Depuis 1998, il travaille comme cinéaste indépendant et écrit des scénarios pour courts et longs métrages.

En 2001, il est finaliste du Hermann-Ganz-Preis (concours littéraire de la Société Suisse des Ecrivaines et Ecrivains, en allemand).

Franz Josef Holzer est membre de la SSA (comme auteur), de Suissimage (comme producteur), de l'ARF et de Fonction:Cinéma.